Jeong, C.; Balanovsky, O.; Lukianova, E.; Kahbatkyzy, N.; Flegontov, P.; Zaporozhchenko, V.; Immel, A.; Wang, C.-C.; Ixan, O.; Khussainova, E. et al.; Bekmanov, B.; Zaibert, V.; Lavryashina, M.; Pocheshkhova, E.; Yusupov, Y.; Agdzhoyan, A.; Sergey, K.; Bukin, A.; Nymadawa, P.; Churnosov, M.; Skhalyakho, R.; Daragan, D.; Bogunov, Y.; Bogunova, A.; Shtrunov, A.; Dubova, N.; Zhabagin, M.; Yepiskoposyan, L.; Churakov, V.; Pislegin, N.; Damba, L.; Saroyants, L.; Dibirova, K.; Artamentova, L.; Utevska, O.; Idrisov, E.; Kamenshchikova, E.; Evseeva, I.; Metspalu, M.; Robbeets, M.; Djansugurova, L.; Balanovska, E.; Schiffels, S.; Haak, W.; Reich, D.; Krause, J.: Characterizing the genetic history of admixture across inner Eurasia. bioRxiv, 327122 (2018)

Wang, C.-C.; Reinhold, S. R.; Kalmykov, A.; Wissgott, A.; Brandt, G.; Jeong, C.; Cheronet, O.; Ferry, M.; Harney, E.; Keating, D. et al.; Mallick, S.; Rohland, N.; Stewardson, K.; Kantorovich, A. R.; Maslov, V. E.; Petrenko, V. G.; Erlikh, V. R.; Atabiev, B. C.; Magomedov, R. G.; Kohl, P. L.; Alt, K. W.; Pichler, S. L.; Gerling, C.; Meller, H.; Vardanyan, B.; Yeganyan, L.; Rezepkin, A. D.; Mariaschk, D.; Berezina, N. Y.; Gresky, J.; Fuchs, K.; Knipper, C.; Schiffels, S.; Balanovska, E.; Balanovsky, O.; Mathieson, I.; Higham, T.; Berezin, Y. B.; Buzhilova, A. P.; Trifonov, V.; Pinhasi, R.; Belinskiy, A. B.; Reich, D.; Hansen, S.; Krause, J.; Haak, W.: The genetic prehistory of the Greater Caucasus. bioRxiv, 322347 (2018), 30 S.

Narasimhan, V. M.; Patterson, N. J.; Moorjani, P.; Lazaridis, I.; Mark, L.; Mallick, S.; Rohland, N.; Bernardos, R.; Kim, A. M.; Nakatsuka, N. et al.; Olalde, I.; Coppa, A.; Mallory, J.; Moiseyev, V.; Monge, J.; Olivieri, L. M.; Adamski, N.; Broomandkhoshbacht, N.; Candilio, F.; Cheronet, O.; Culleton, B. J.; Ferry, M.; Fernandes, D.; Gamarra, B.; Gaudio, D.; Hajdinjak, M.; Harney, E.; Harper, T. K.; Keating, D.; Lawson, A.-M.; Michel, M.; Novak, M.; Oppenheimer, J.; Rai, N.; Sirak, K.; Slon, V.; Stewardson, K.; Zhang, Z.; Akhatov, G.; Bagashev, A. N.; Baitanayev, B.; Bonora, G. L.; Chikisheva, T.; Derevianko, A.; Dmitry, E.; Douka, K.; Dubova, N.; Epimakhov, A.; Freilich, S.; Fuller, D.; Goryachev, A.; Gromov, A.; Hanks, B.; Judd, M.; Kazizov, E.; Khokhlov, A.; Kitov, E.; Kupriyanova, E.; Kuznetsov, P.; Luiselli, D.; Maksudov, F.; Meiklejohn, C.; Merrett, D. C.; Micheli, R.; Mochalov, O.; Zahir, M.; Mustafakulov, S.; Nayak, A.; Petrovna, R. M.; Pettner, D.; Potts, R.; Razhev, D.; Sarno, S.; Sikhymbaevae, K.; Slepchenko, S. M.; Stepanova, N.; Svyatko, S.; Vasilyev, S.; Vidale, M.; Voyakin, D.; Yermolayeva, A.; Zubova, A.; Shinde, V. S.; Lalueza-Fox, C.; Meyer, M.; Anthony, D.; Boivin, N. L.; Thangaraj, K.; Kennett, D.; Frachetti, M.; Pinhasi, R.; Reich, D.: The genomic formation of South and Central Asia. bioRxiv, 292581 (2018), 32 S.

Lamnidis, T. C.; Majander, K.; Jeong, C.; Salmela, E.; Wessman, A.; Moiseyev, V.; Khartanovich, V.; Balanovsky, O.; Ongyerth, M.; Weihmann, A. et al.; Sajantila, A.; Kelso, J.; Pääbo, S.; Onkamo, P.; Haak, W.; Krause, J.; Schiffels, S.: Ancient Fennoscandian genomes reveal origin and spread of Siberian ancestry in Europe. bioRxiv, 285437 (2018), 25 S.

Amorim, C. E. G.; Vai, S.; Posth, C.; Modi, A.; Koncz, I.; Hakenbeck, S.; La Rocca, M. C.; Mende, B.; Bobo, D.; Pohl, W. et al.; Baricco, L. P.; Bedini, E.; Francalacci, P.; Giostra, C.; Vida, T.; Winger, D.; von Freeden, U.; Ghirotto, S.; Lari, M.; Barbujani, G.; Krause, J.; Caramelli, D.; Geary, P. J.; Veeramah, K. R.: Understanding 6th-Century Barbarian Social Organization and Migration through Paleogenomics. bioRxiv, 268250 (2018), 27 S.

Velsko, I. M.; Frantz, L. A. F.; Herbig, A.; Larson, G.; Warinner, C. G.: Selection of appropriate metagenome taxonomic classifiers for ancient microbiome research. bioRxiv, 260042 (2018), 41 S.

Chacon-Duque, J. C.; Adhikari, K.; Fuentes-Guajardo, M.; Mendoza-Revilla, J.; Acuna-Alonzo, V.; Barquera Lozano, R.; Quinto-Sanchez, M.; Gomez-Valdes, J.; Everardo Martinez, P.; Villamil-Ramirez, H. et al.; Hunemeier, T.; Ramallo, V.; Silva de Cerqueira, C. C.; Hurtado, M.; Villegas, V.; Granja, V.; Villena, M.; Vasquez, R.; Llop, E.; Sandoval, J. R.; Salazar-Granara, A. A.; Parolin, M.-L.; Sandoval, K.; Penaloza-Espinosa, R. I.; Rangel-Villalobos, H.; Winkler, C.; Klitz, W.; Bravi, C.; Molina, J.; Corach, D.; Barrantes, R.; Gomes, V.; Resende, C.; Gusmao, L.; Amorim, A.; Xue, Y.; Dugoujon, J.-M.; Moral, P.; Gonzalez-Jose, R.; Schuler-Faccini, L.; Salzano, F. M.; Bortolini, M.-C.; Canizales-Quinteros, S.; Poletti, G.; Gallo, C.; Bedoya, G.; Rothhammer, F.; Balding, D.; Hellenthal, G.; Ruiz-Linares, A.: Latin Americans show wide-spread Converso ancestry and the imprint of local Native ancestry on physical appearance. bioRxiv, 252155 (2018), 22 S.

Key, F. M.; Abdul-Aziz, M. A.; Mundry, R.; Peter, B.; Sekar, A.; D Amato, M.; Dennis, M. Y.; Schmidt, J. M.; Andres, A. M.: Human local adaptation of the TRPM8 cold receptor along a latitudinal cline. bioRxiv, 251033 (2018), 30 S.

Potter, B. A.; Beaudoin, A. B.; Haynes, C. V.; Holliday, V. T.; Holmes, C. E.; Ives, J. W.; Kelly, R.; Llamas, B.; Malhi, R.; Miller, S. et al.; Reich, D.; Reuther, J. D.; Schiffels, S.; Surovell, T.: Arrival routes of first Americans uncertain. Science 359 (6381) S. 1224 - 1225 (2018), 2 S.

Maturana, P. R.; Brewer, B. J.; Klaere, S.; Bouckaert, R.: Model selection and parameter inference in phylogenetics using Nested Sampling. bioRxiv, 1703.05471 (2017), 22 S.

Bouckaert, R. R.; Robbeets, M.: Pseudo Dollo models for the evolution of binary characters along a tree. bioRxiv, 207571 (2017), 12 S.

Knauf, S.; Gogarten, J.; Schuenemann, V. J.; Nys, H. M. D.; Duex, A.; Strouhal, M.; Mikalova, L.; Bos, K. I.; Armstrong, R.; Batamuzi, E. K. et al.; Chuma, I. S.; Davoust, B.; Diatta, G.; Fyumagwa, R. D.; Kazwala, R. R.; Keyyu, J. D.; Lejora, I. A. V.; Levasseur, A.; Liu, H.; Mayhew, M. A.; Mediannikov, O.; Raoult, D.; Wittig, R. M.; Roos, C.; Leendertz, F. H.; Smajs, D.; Nieselt, K.; Krause, J.; Calvignac-Spencer, S.: African nonhuman primates are infected with the Yaws bacterium Treponema pallidum subsp. pertenue. bioRxiv, 135491 (2017), 9 S.

Mathieson, I.; Roodenberg, S. A.; Posth, C.; Szécsényi-Nagy, A.; Rohland, N.; Mallick, S.; Olalde, I.; Broomandkhoshbacht, N.; Cheronet, O.; Fernandes, D. et al.; Ferry, M.; Gamarra, B.; Fortes, G. G.; Haak, W.; Harney, E.; Krause-Kyora, B.; Kucukkalipci, I.; Michel, M.; Mittnik, A.; Nägele, K.; Novak, M.; Oppenheimer, J.; Patterson, N.; Pfrengle, S.; Sirak, K.; Stewardson, K.; Vai, S.; Alexandrov, S.; Alt, K. W.; Andreescu, R.; Antonović, D.; Ash, A.; Atanassova, N.; Bacvarov, K.; Gusztáv, M. B.; Bocherens, H.; Bolus, M.; Boroneanţ, A.; Boyadzhiev, Y.; Budnik, A.; Burmaz, J.; Chohadzhiev, S.; Conard, N. J.; Cottiaux, R.; Čuka, M.; Cupillard, C.; Drucker, D. G.; Elenski, N.; Francken, M.; Galabova, B.; Ganetovski, G.; Gely, B.; Hajdu, T.; Handzhyiska, V.; Harvati, K.; Higham, T.; Iliev, S.; Janković, I.; Karavanić, I.; Kennett, D. J.; Komšo, D.; Kozak, A.; Labuda, D.; Lari, M.; Lazar, C.; Leppek, M.; Leshtakov, K.; Vetro, D. L.; Los, D.; Lozanov, I.; Malina, M.; Martini, F.; McSweeney, K.; Meller, H.; Menđušić, M.; Mirea, P.; Moiseyev, V.; Petrova, V.; Price, T. D.; Simalcsik, A.; Sineo, L.; Šlaus, M.; Slavchev, V.; Stanev, P.; Starović, A.; Szeniczey, T.; Talamo, S.; Teschler-Nicola, M.; Thevenet, C.; Valchev, I.; Valentin, F.; Vasilyev, S.; Veljanovska, F.; Venelinova, S.; Veselovskaya, E.; Viola, B.; Virag, C.; Zaninović, J.; Zäuner, S.; Stockhammer, P. W.; Catalano, G.; Krauß, R.; Caramelli, D.; Zariņa, G.; Gaydarska, B.; Lillie, M.; Nikitin, A. G.; Potekhina, I.; Papathanasiou, A.; Borić, D.; Bonsall, C.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.: The genomic history of Southeastern Europe. bioRxiv, 135616 (2017), 30 S.

Olalde, I.; Brace, S.; Allentoft, M. E.; Armit, I.; Kristiansen, K.; Rohland, N.; Mallick, S.; Booth, T.; Szécsényi-Nagy, A.; Mittnik, A. et al.; Altena, E.; Lipson, M.; Lazaridis, I.; Patterson, N. J.; Broomandkhoshbacht, N.; Diekmann, Y.; Faltyskova, Z.; Fernandes, D. M.; Ferry, M.; Harney, E.; de Knijff, P.; Michel, M.; Oppenheimer, J.; Stewardson, K.; Barclay, A.; Alt, K. W.; Fernández, A. A.; Bánffy, E.; Bernabò-Brea, M.; Billoin, D.; Blasco, C.; Bonsall, C.; Bonsall, L.; Allen, T.; Büster, L.; Carver, S.; Navarro, L. C.; Craig, O. E.; Cook, G. T.; Cunliffe, B.; Denaire, A.; Dinwiddy, K. E.; Dodwell, N.; Ernée, M.; Evans, C.; Kuchařík, M.; Farré, J. F.; Fokkens, H.; Fowler, C.; Gazenbeek, M.; Pena, R. G.; Haber-Uriarte, M.; Haduch, E.; Hey, G.; Jowett, N.; Knowles, T.; Massy, K.; Pfrengle, S.; Lefranc, P.; Lemercier, O.; Lefebvre, A.; Maurandi, J. L.; Majó, T.; McKinley, J. I.; McSweeney, K.; Gusztáv, M. B.; Modi, A.; Kulcsár, G.; Kiss, V.; Czene, A.; Patay, R.; Endródi, A.; Köhler, K.; Hajdu, T.; Cardoso, J. L.; Liesau, C.; Pearson, M. P.; Włodarczak, P.; Price, T. D.; Prieto, P.; Rey, P.-J.; Ríos, P.; Risch, R.; Guerra, M. A. R.; Schmitt, A.; Serralongue, J.; Silva, A. M.; Smrčka, V.; Vergnaud, L.; Zilhão, J.; Caramelli, D.; Higham, T.; Heyd, V.; Sheridan, A.; Sjögren, K.-G.; Thomas, M. G.; Stockhammer, P. W.; Pinhasi, R.; Krause, J.; Haak, W.; Barnes, I.; Lalueza-Fox, C.; Reich, D.: The Beaker Phenomenon and the genomic transformation of Northwest Europe. bioRxiv, 135962 (2017), 28 S.

Velsko, I. M.; Overmyer, K. A.; Speller, C.; Collins, M.; Loe, L.; Frantz, L. A. F.; Martinez, J. B. R.; Chavez, E.; Klaus, L.; Sankaranarayanan, K. et al.; Lewis Jr., C. M. L.; Coon, J. J.; Larson, G.; Warinner, C. G.: The dental calculus metabolome in modern and historic samples. bioRxiv, 136176 (2017), 40 S.

Herbig, A.; Maixner, F.; Bos, K. I.; Zink, A.; Krause, J.; Huson, D. H.: MALT: Fast alignment and analysis of metagenomic DNA sequence data applied to the Tyrolean Iceman. bioRxiv, 050559 (2017), 16 S.

Lipson, M.; Szécsényi-Nagy, A.; Mallick, S.; Pósa, A.; Stégmár, B.; Keerl, V.; Rohland, N.; Stewardson, K.; Ferry, M.; Michel, M. et al.; Oppenheimer, J.; Broomandkhoshbacht, N.; Harney, E.; Nordenfelt, S.; Llamas, B.; Mende, B. G.; Köhler, K.; Oross, K.; Bondár, M.; Marton, T.; Osztás, A.; Jakucs, J.; Paluch, T.; Horváth, F.; Csengeri, P.; Koós, J.; Sebok, K.; Anders, A.; Raczky, P.; Regenye, J.; Barna, J. P.; Fábián, S.; Serlegi, G.; Toldi, Z.; Nagy, E. G.; Dani, J.; Molnár, E.; Pálfi, G.; Márk, L.; Melegh, B.; Bánfai, Z.; Fernández-Eraso, J.; Mujika-Alustiza, J. A.; Fernández, C. A.; Echevarría, J. J.; Bollongino, R.; Orschiedt, J.; Schierhold, K.; Meller, H.; Cooper, A.; Burger, J.; Bánffy, E.; Alt, K. W.; Lalueza-Fox, C.; Haak, W.; Reich, D.: Parallel ancient genomic transects reveal complex population history of early European farmers. bioRxiv, 114488 (2017), 34 S.

Mittnik, A.; Wang, C.-C.; Pfrengle, S.; Daubaras, M.; Zariņa, G.; Hallgren, F.; Allmäe, R.; Khartanovich, V.; Moiseyev, V.; Furtwängler, A. et al.; Andrades Valtueña, A.; Feldman, M.; Economou, C.; Oinonen, M.; Vasks, A.; Tõrv, M.; Balanovsky, O.; Reich, D.; Jankauskas, R.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: The genetic history of Northern Europe. bioRxiv, 113241 (2017), 26 S.

Gokhman, D.; Agranat-Tamir, L.; Housman, G.; Nissim-Rafinia, M.; Nieves-Colón, M.; Gu, H.; Ferrando-Bernal, M.; Gelabert, P.; Lipende, I.; Quillen, E. E. et al.; Meissner, A.; Stone, A. C.; Pusey, A. E.; Mjungu, D.; Kandel, L.; Liebergall, M.; Prada, M. E.; Vidal, J. M.; Krause, J.; Yakir, B.; Pääbo, S.; Reich, D.; Lalueza-Fox, C.; Marques-Bonet, T.; Meshorer, E.; Carmel, L.: Recent regulatory changes shaped human facial and vocal anatomy. bioRxiv, 106955 (2017), 24 S.

Bauer, J. S.; Fillinger, S.; Förstner, K.; Herbig, A.; Jones, A. C.; Flinspach, K.; Sharma, C.; Gross, H.; Nieselt, K.; Apel, A. K.: dRNA-seq transcriptional profiling of the FK506 biosynthetic gene cluster in Streptomyces tsukubaensis NRRL18488 and general analysis of the transcriptome. RNA Biology 14 (11) S. 1617 - 1626 (2017), 11 S.